Napriek tomu však neexistujú dôkazy, že sa priamo podieľal na ich organizácii, či nariaďovaní. [[6. septembra]] [[2003]] podnikla izraelská stíhačka [[F-16]] letecký útok na Jásínov dom v Gaze, Jásín však tento útok so zraneniami prežil. Po útoku vyhlásil, že sa smrti nebojí a keby aj zomrel, [[džihád]] to nezastaví.
Jásín bol nakoniec zavraždenízavraždený 22. marca 2004, keď na neho izraelský vrtuľník typu Apache [[AH-64]] vypálila niekoľko riadených striel, keď vychádzal z mešity po rannej modlitbe. Okrem neho pri tomto útoku zahynuli aj dvaja jeho bodyguardi a deväť okolostojacich civilistov. Jeho smrť vyvolala medzi Palestínčanmi veľký hnev a pobúrenie a na jeho pohrebe sa zúčastnilo vyše 200 000 ľudí. Útok odsúdilo aj mnoho iných, prevažne arabských krajín a napr. aj generálny tajomník [[OSN]] [[Kofi Annan]]. Izraelský predstavitelia však atentát ospravedlňovali obranou proti terorizmu a Jásína označil za „palestínskeho [[Usáma bin Ládin|bin Ládin]]a“, v podobnom duchu sa Izraela zastali aj [[Spojené štáty]].
