Základnou štruktúrnou stavebnou jednotkou zeolitov sú [[tetraéder|tetraédre]] [SiO<sub>4</sub>]<sup>4-</sup>, ktoré sú navzájom pospájané spoločným kyslíkovým [[ión]]om. [[Kremík]] môže byť v tetraédroch nahradzovaný [[hliník]]om, ktorý je však len trojmocný a preto bunka preto nadobúda záporný náboj. Na toto voľné miesto sa môže viazať katioónkatión [[kov]]u, ktorý je však len slabo viazaný a môže byť ľahko vymenený za iný katión<ref name="Domaracký, Rybárová 2001"/>. Kremík v mriežke môže byť zastupovaný aj [[fosfor]]om. Hliník môžu substituovať [[stroncium]] alebo [[železo]]. Štruktúra zeolitov je podobná [[živec|živcom]], resp. [[foidy|foidom]]. Napr. [[thomsonit]] bez vody je porovnateľný s [[anortit]]om, ktorý má vyšší obsah Na namiesto Ca. [[Analcím]] je na sodík a laumontit na vápnik bohatým ekvivalentom [[foid]]u - [[leucit]]u. [[Heulandit]] a zeolity [[phillipsit]]ového a [[chabasit]]ového radu sú podobné [[plagioklas]]om<ref>{{cite web|url=http://zeolity.brych.cz/zeolity.php |title=Zeolity|publisher=brych.cz|date=27.5.2009}}</ref>.
