Narodil sa 25. júna 1926 v [[Pozdišovce|Pozdišovciach]] pri Michalovciach. Od roku 1946 študoval na Vysokej bohosloveckej škole v [[Prešov]]e. 1. januára 1951 neverejne prijal kňazskú vysviacku v nemocničnej kaplnke v [[Rožňave]] ako neženatý gréckokatolík z rúk rožňavského rímskokatolíckeho biskupa [[Róberta Pobožného]], pretože gréckokatolícki biskupi bl. [[Pavol Gojdič]] a bl. [[Vasiľ Hopko]] už boli internovaní. [[Gréckokatolícka cirkev]] bola v tom čase postavená mimo zákona. Svoje povolanie nemohol vykonávať a manuálne pracoval ako drevorubač a baník v Čechách a na Morave. V roku 1955 po tom ako pracoval v pekárni vo [[Vranove nad Topľou]] sa ukrýval skoro dva roky v [[Ložín]]e na Zemplíne, lebo mu hrozilo zatknutie pre tajnú dušpastiersku činnosť. [[]]ŠTB ]]a jej spolupracovníci ho však predsa vypátrali a po súdnych procesoch v Prešove[[Prešov]]e a na [[Pankrác]]i v [[Prahe]] bol odsúdený na štyri roky, z ktorých si dva odsedel. Ako väzeň opäť pracoval ako baník v Podkrkonoší. Keďže ako vedľajší trest mal zákaz pobytu vo [[Východoslovenskom kraji]], aj po prepustení z väzenia musel ostať v [[Čechách]], kde až do roku 1968 pracoval ako kopáč na stavbách plynovodu. V januári 1968 po politických zmenách, ešte pred obnovením činnosti gréckokatolíckej cirkvi pomáhal biskupovi bl. Vasiľovi Hopkovi v Oseku u Duchcova, kde bol blažený biskup – mučeník nedobrovoľne internovaný komunistickou mocou V júni roku 1968 po obnovení činnosti Gréckokatolíckej cirkvi sa zapojil do aktívnej pastoračnej práce. Od roku 1969 až do roku 1990 bol veľmi blízkym spolupracovníkom ordinára Mons. [[Jána Hirku]] ako aktuár a ceremoniár na biskupskom úrade v Prešove. Potom bol farárom v [[Ďurďoš]]i vo vranovskom regióne. V roku 1993 sa stal riaditeľom vikariátu pre gréckokatolíkov v Českej republike. V roku 1996 od ustanovenia [[Apoštolského exarchátu]] v Prahe bol jeho protosynkelom - generálnym vikárom. Pracoval po boku prvého pražského apoštolského exarchu vladyku [[Ivana Ljavinca]]. V marci 2002 ho Svätý Otec [[Ján Pavol II.]] menoval pápežským [[prelát]]om za jeho zásluhy a obetavú prácu pre [[Gréckokatolícku cirkev]]. Od mája roku 2003, od intronizácie vladyku [[]]Ladislava Hučka]], apoštolského exarchu pre Českú republiku bol jeho synkel – biskupský vikár.
24. apríla 2004 vo Vatikáne bolo oficiálne oznámené rozhodnutie Svätého Otca [[Jána Pavla II.]] povýšiť do hodnosti titulárného biskupa abrittského Mons. Jána Eugena Kočiša, pápežského preláta a dovtedajšieho protosynkela Apoštolského exarchátu pre katolíkov byzantského obradu – gréckokatolíkov v Českej republike. Jeho konsekrácia na biskupa bola 3.decembra 1967, ako uvádza [[]]Annuario Pontificio]].
15. mája 2004 prijal biskupskú vysviacku "sub conditione" v [[]]Katedrále sv. Klimenta v Prahe]] z rúk vladyku [[]]Ďurja Džudžara]], apoštolského exarchu pre [[Srbsko]] a [[Čiernu Horu]]. Spolusvätiteľmi boli otcovia biskupi [[Ján Babjak]], prešovský eparcha a [[Ladislav Hučko]], pražský apoštolský exarcha. Od 7. októbra 2006 je emeritným biskupom. Vladyka Ján Eugen je horlivý a príkladný nástupca apoštolov, zakladajúci člen [[Spolok sv. Cyrila a Metoda|Spolku sv. Cyrila a Metoda]].
