Pilsko sa nachádza na [[poľsko]]-[[Slovensko|slovenskej]] hranici, ktorá prechádza {{m|400|m}} pod vrcholom hory, teda vrchol sa nachádza na slovenskej stane. Na slovenskej strane je začlenený do [[Štátna prírodná rezervácia Pilsko|Štátnej prírodnej rezervácie Pilsko]] a na poľskej strane do Rezervatu przyrodniego Pilsko. Podobne ako mnohé pohoria na poľsko-slovenskej hranici patrí aj Pilsko medzi pohoria, ktoré sú hranicou medzi úmoriami. Potoky zo severnej strany patria do úmoria [[Baltské more|Baltského mora]], zatiaľ čo vodné toky z južnej strany patria do úmoria [[Čierne more|Čierneho mora]].
