Podľa [[Emila Karola Kautského|Emil Karol Kautský|Emila Karola Kautského]], zaoberajúceho sa analýzou historických okolností Štefánikovej smrti, majú nepriame dôkazy a štúdium povojnového vývoja v Česko-Slovensku naznačovať, že sa stal obeťou stretu francúzskeho a talianskeho geopolitického záujmu v strednej Európe či mocenských ambícií [[Edvard Beneš|Edvarda Beneša]] a [[Tomáš Garrigue Masaryk|Tomáša G. Masaryka]].<ref>{{Citácia knihy | priezvisko = Kautský | meno = Emil Karol | titul = Kauza Štefánik (Legendy, fakty a otázniky okolo vzniku Česko-Slovenskej republiky) | redaktori = Vlasta De Riggová | ďalší = Lektorácia Ladislav Deák, Príprava vydania Igor Sokolík, Obálka a grafická úprava Ivan Bílý | vydanie = 2 | typ vydania = doplnené | vydavateľ = Vydavateľstvo Matice slovenskej | miesto = Martin | rok = 2007 | počet strán = 312 | isbn = 978-80-89208-68-5 }}</ref> Tomuto faktu nasvedčuje prudké nepriateľstvo medzi Štefánikom a Benešom po odhalení Benešovej tajne podpísanej zmluvy s Francúzskom (v neprospech Talianska) a po zistení spreneverenia darov zahraničných Slovákov na chod česko-slovenských légií.
Podľa zástancov tejto teórie sú dôkazmi o atentáte pitevná správa, priebeh nehody ako aj fakt, že svedecké výpovede obsahujúce zmienku o streľbe boli vyšetrujúcimi orgánmi ignorované.
