[[13. október|13. októbra]] [[2007]] sa oženil s novinárkou Beátou Oravcovou.<ref>{{Citácia elektronického dokumentu | autor = zh | titul = Lipšic sa v sobotu oženil s Beatou Oravcovou | url = http://www.sme.sk/c/3537054/lipsic-sa-v-sobotu-ozenil-s-beatou-oravcovou.html | dátum vydania = 2007-10-15 | dátum prístupu = 2013-10-16 | vydavateľ = TASR; ČTK; SME}}</ref><ref>{{Citácia elektronického dokumentu | priezvisko = Kernová | meno = Mirka | titul = Keď polovičky novinárov vstúpia do politiky | url = http://medialne.etrend.sk/televizia/ked-polovicky-novinarov-vstupia-do-politiky.html | dátum vydania = 2010-07-21 | dátum prístupu = 2014-02-14 | vydavateľ = Mediálne.Trend.sk}}</ref> [[3. december|3. decembra]] [[2009]] sa im narodil syn AlexAlexander<ref>{{Citácia elektronického dokumentu | titul = Daniel Lipšic má syna! | url = http://m.tvnoviny.sk/bin/mobile/index.php?article_id=530602 | dátum vydania = 2009-12-03 | dátum prístupu = 2014-02-14 | vydavateľ = Markíza TV noviny}}</ref> (máa dvoch[[5. synov)október|5. októbra]] [[2011]] syn Peter.<ref>{{Citácia elektronického dokumentu | titul = Lipšic je dvojnásobným otcom! Manželka mu porodila syna Peťka | url = http://www.lipsiccas.sk/wp-contentclanok/uploads207848/2012/08/CV_Daniel_Lipsic_SKlipsic-je-dvojnasobnym-otcom-manzelka-mu-porodila-syna-petka.pdfhtml | dátum vydania = 2011-10-05 | dátum prístupu = 2014-02-14 | vydavateľ = Nový čas}}</ref> Lipšic v súčasnosti býva v [[Bratislava|Bratislave]]. Má jedného brata, dvojča [[Doktor medicíny|MUDr.]] Erika Lipšica (* [[1973]]), ktorý pôsobí ako špecialista na [[kardiológia|intervenčnú kardiológiu]] v nemocničnom centre [[Rijksuniversiteit Groningen|Groningenskej univerzity]] v holandskom meste [[Groningen (mesto v Holandsku)|Groningen]].<ref>{{Citácia elektronického dokumentu | autor name= pol | titul = Žijú v tieni súrodencov: Čím sa živia bratia našich politikov?| url = http://www.cas.sk/clanok/207173/ziju-v-tieni-surodencov-cim-sa-zivia-bratia-nasich-politikov.html | dátum vydania = 2011-09-05 | dátum prístupu = 2014-02-14 | vydavateľ = Nový čas}}</ref><ref>{{Citácia elektronického dokumentu | titul = Erik Lipsic | url = http://nl.linkedin.com/pub/erik-lipsic/8/6/161 | dátum prístupu = 2014-02-14 | vydavateľ = LinkedIn}}</ref><ref>{{Citácia elektronického dokumentu | titul = Erik Lipsic : University of Groningen, University Medical Center Groningen | url = http://www.researchgate.net/profile/Erik_Lipsic/ | dátum prístupu = 2014-02-14 | vydávateľ = ResearchGate.net}}</ref>
