Iniesta reprezentoval Španielsko v mládežníckych kategóriach a od roku [[2006]] aj seniorské národné mužstvo. Debutoval v zápase proti [[Ruské národné futbalové mužstvo|Rusku]], [[27. máj]]a [[2006]]. Bol nominovaný aj pre [[Majstrovstvá sveta vo futbale 2006|Majstrovstvá sveta 2006]] a, [[Majstrovstvá Európy vo futbale 2008|Majstrovstvá Európy 2008]] na ktorých aj triumfoval. Na Majstrovstvách sveta 2010 v JAR strelil vo finále v predĺžení proti Holandsku víťazný gól, ktorý venoval vyzlečením dresu zosnulému kamarátovi Dani Jarquemu a stal sa tak s mužstvom majstrom sveta. Na Majstrovstvách Európy 2012 v Poľsku a na Ukrajine, kde bol jednou z najväčších opôr reprezentácie obhájil s mužstvom Španielska európsky primát. V roku 2014 sa zúčastní s reprezentáciou La furia roja aj majstrovstiev sveta v Brazílii.
