[[Súbor:Phylogenetic_tree.svg|thumb|Fylogenetický strom základných skupín organizmov zostavený na základe štúdia r[[RNA]]]]
'''Fylogenéza''' sú na základe dedukcie vyvodené vývojové línie skupiny [[organizmus|organizmov]], vrátane rekonštrukcie spoločného predka a súhrnu všetkých vetvení jednotlivých [[vývojová vetva|vývojových vetiev]] v priebehu geologických období Zeme. Vyobrazenie fylogenézy sa nazýva ''fylogenetický strom'', ktorého vetvy predstavujú vývojové línie danej skupiny.
Vedecký odbor biológie, ktorý sa zaoberá fylogenézou je '''fylogenetika'''. Súčasné [[taxonómia (biológia)|taxonomické]] delenie organizmov je väčšinou založené na fylogenéze, čo znamená že vytvárame také taxonomické skupiny organizmov, v ktorých všetky druhy v rámci danej skupiny pochádzajú z viac-menej hypotetického spoločného predka.
Fylogenetika skúma aj postupný vývoj jednotlivých funkčných častí tela organizmov. (napr. fylogenézu tráviacej sústavy živočíchov, fylogenézu kvetov rastlín a podobne).
