Eukaryoty: Rozdiel medzi revíziami

Pridaných 1 086 bajtov ,  pred 6 mesiacmi
chýba zhrnutie úprav
d
Značky: odkaz do inej Wikipédie sekcia Referencie
{| style="border-collapse: collapse; border-color: #AAAAAA; float:right; width:260px; margin-left: 1em;" border="1" cellspacing="0" align="right" cellpadding="2"
|-----
! bgcolor="#cccc99CCCC99" | Eukaryoty
|-----
| align="center" | [[Súbor:Eukaryota diversity 1.JPG|250px]]<br /><small>Príklady rôznych eukaryotických organizmov</small>
|-----
! bgcolor="#cccc99CCCC99" | Vedecký názov
|-----
!''Eukaryota''<br /><small>[[Robert Whittaker|Whittaker]], [[Lynn Margulis|Margulis]], [[1978]]</small>
| [[Synonymum|Synonymá]]:<br /><small>Jadrové organizmy, nukleobionty, Eukarya</small>
|-----
! bgcolor="#cccc99CCCC99" | SuperskupinyRíše
|-
|[[Meňavkovce (Amoebozoa)|Amoebozoa]]
|Amorphea
Obazoa
 
CRuMs
 
[[Exkaváty|Excavata]]
 
[[Rastliny|Archaeplastida]]
 
Sar
TSAR
 
[[Kryptomonády|Cryptista]]
 
Haptista
 
Hemimastigophora
|-----
! bgcolor=#CCCC99 align="center" bgcolor="#cccc99" | <small>[[Vedecká klasifikácia]] prevažne podľa [[Systém živých organizmov#Živočíchy|tohto článku]]</small>
|}
 
Bunky eukaryotov obsahujú menšie štruktúry, [[organela|organely]], ktoré sú tiež obalené fosfolipidovými membránami, preto ich nazývame organely endomembránovej sústavy. Okrem jadra sú to napríklad [[mitochondria|mitochondrie]], [[plastid]]y a ďalšie. Toto je jeden z hlavných znakov, ktorým sa odlišujú od organizmov s jadrom neobaleným membránou, tzv. prokaryotov. Ďalší rozdiel medzi prokaryotmi a eukaryotmi je v ich [[ribozóm]]och (malých organelách slúžiacich na syntézu [[bielkovina|bielkovín]]): Cytoplazmatické ribozómy eukaryotov sú väčšie a ťažšie ako ribozómy [[prokaryoty|prokaryotov]]. Ribozómy eukaryotov v plastidoch a mitochondriách sú však veľkosťou a hmotnosťou podobné ribozómom prokaryotov. Táto skutočnosť je jedným z dôkazov podporujúcich [[endosymbiotická teória|endosymbiotickú teóriu]] vzniku eukaryotických organizmov. Ďalší zásadný odlišný znak prokaryotov a eukaryotov je, že dedičná látka eukaryotov ([[deoxyribonukleová kyselina|DNA]]) je naviazaná na [[histón|bázické bielkoviny]].
 
Podľa často uvádzanej endosymbiotickej teórie vznikli eukaryotické bunky [[evolúcia (biológia)|evolučne]] z prokaryotických buniek. Eukaryoty dosiahli od svojho vzniku pred 1,8 až 1,3 miliardami rokov značné množstvo foriem a patria medzi ne najväčšie organizmy na Zemi. Z [[taxonómia (biológia)|taxonomického]] hľadiska ide spravidla o jednu zo základných skupín živých organizmov. Tradične sa členili na tieto základné taxóny: [[prvoky]], [[chromista]], [[rastliny]], [[huby]] a [[živočíchy]].<ref>{{Citácia elektronického dokumentu|titul=Systém eukaryot (starší/tradiční pojetí) - Biomach, výpisky z biologie|url=http://www.biomach.cz/obecna-biologie-4/novy-system-organismua-1|vydavateľ=www.biomach.cz|dátum prístupu=2020-01-21}}</ref> Aktuálne sa však užíva fylogenetická klasifikácia podložená molekulárnymi dátami. Podľa nej eukaryoty zaraďujeme do tzv. superskupínnadskupín.
 
== Eukaryotická bunka ==
Donedávna bolo bežné členenie organizmov do troch domén z roku [[1990]].<ref name=taxonomicon>{{Citácia elektronického dokumentu |meno= |priezvisko= |titul=Domain Eukaryota - eukaryotes |url=http://taxonomicon.taxonomy.nl/TaxonTree.aspx?id=71606&tree=0.1 |vydavateľ=Universal Taxonomic Services |dátum vydania=2009-10-17 |dátum aktualizácie= |dátum prístupu=2010-02-04 |jazyk=po anglicky}}</ref><ref>{{citácia elektronického dokumentu | titul = Biolib - Eukaryota (jaderní) | url = http://www.biolib.cz/cz/taxon/id14783/}}</ref> Eukaryota a [[Archea]] boli spoločne zaraďované do skupiny [[Neomura]]. Tieto dve domény sú si naozaj navzájom príbuzné, ale dnes sa väčšinou eukaryoty kladú ako súčasť taxónu ASGARD priamo uprostred archeí.<ref name=pmid11837318/><ref name=origin>{{Citácia periodika |meno=T. |priezvisko=Cavalier-Smith |mesiac= |rok=1987 |titul=The origin of eukaryotic and archaebacterial cells |periodikum=Annals of the New York Academy of Sciences |ročník=503 |číslo= |strany=17–54 |pmid=3113314 |doi=10.1111/j.1749-6632.1987.tb40596.x |jazyk=po anglicky}}</ref><ref>{{Citácia elektronického dokumentu|titul=Živa – Nenápadná diverzita prokaryot (Lukáš Falteisek)|url=http://ziva.avcr.cz/2019-5/nenapadna-diverzita-prokaryot.html|vydavateľ=ziva.avcr.cz|dátum prístupu=2020-01-21}}</ref>
 
Klasifikácia eukarotov na úroveň niekdajších ríší sa začína pomaly ustáľovať na systéme takzvaných [[Superskupinanadskupina|superskupínnadskupín]]. Zatiaľ čo napríklad väčšina učebníc sa stále drží taxónov ako prvoky alebo chromista,<ref name=taxonomicon /> aktuálne systémy s týmito termínmi takmer vôbec či vôbec nepracujú.<ref>{{Citácia elektronického dokumentu|titul=Živa – Proměny vyšší systematiky eukaryot a její odraz ve středoškolské biologii (Tomáš Macháček, Kateřina Mikešová, Libuše Turjanicová, Vladimír Hampl)|url=http://ziva.avcr.cz/2016-1/promeny-vyssi-systematiky-eukaryot-a-jeji-odraz-ve-stredoskolske-biologii.html|vydavateľ=ziva.avcr.cz|dátum prístupu=2020-01-21}}</ref> Do centra pozornosti sa stavia niekoľko taxónov označovaných ako „supergroups“,<ref name=phylogenomics>{{Citácia periodika |meno=Fabien |priezvisko=Burki |meno2=Kamran |priezvisko2=Shalchian-Tabrizi |meno3=Marianne |priezvisko3=Minge |spoluautori=et al. |mesiac= |rok=2007 |titul=Phylogenomics reshuffles the eukaryotic supergroups |periodikum=Plos ONE |ročník=2 |číslo=8 |strany=e790 |pmid=17726520 |pmc=1949142 |doi=10.1371/journal.pone.0000790 |jazyk=po anglicky}}</ref> ktoré zaraďujeme ešte ďalej do väčších nadradených taxónov. Aktuálny systém publikovaný [[Sina M. Adl|Sinom M. Adlom]] pracuje k roku 20202019 sos siedmimideviatimi superskupinami.nadskupinami:<ref>{{Citácia periodika|titul=Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes|doi=10.1111/jeu.12691|meno3=Christopher E.|priezvisko2=Bass|meno2=David|priezvisko=Adl|meno=Sina M.|poznámky=PMID: 30257078
PMCID: PMC6492006|issn=1550-7408|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30257078|strany=4–119|číslo=1|ročník=66|dátum prístupu=2020-01-21|dátum=01 2019|periodikum=The Journal of Eukaryotic Microbiology|priezvisko3=Lane}}</ref><ref>{{Citácia elektronického dokumentu|titul=Živa – Diverzita protist (Ivan Čepička)|url=http://ziva.avcr.cz/2019-5/diverzita-protist.html|vydavateľ=ziva.avcr.cz|dátum prístupu=2020-01-21}}</ref><ref>{{Citácia periodika|titul=The New Tree of Eukaryotes|jazyk=English|meno3=Matthew W.|priezvisko2=Roger|meno2=Andrew J.|priezvisko=Burki|meno=Fabien|poznámky=PMID: 31606140|doi=10.1016/j.tree.2019.08.008|url=https://www.cell.com/trends/ecology-evolution/abstract/S0169-5347(19)30257-5|issn=0169-5347|strany=43–55|číslo=1|ročník=35|dátum prístupu=2020-06-02|dátum=2020-01-01|periodikum=Trends in Ecology & Evolution|priezvisko3=Brown}}</ref> Aj napriek relatívne dobre zmapovaným príbuzenským vzťahom dnes mnoho skupín a rodov nedokážeme zaradiť do žiadnej superskupiny. Sina M. Adl a jeho kolektív takéto organizmy uvádzajú mimo publikovanú klasifikáciu ako '''Eukaryota incertae sedis''', aby sa predčasne zabránilo vzniku [[Vedecká klasifikácia|polyfyletických taxónov]].<ref>{{Citácia periodika|titul=Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes|doi=10.1111/jeu.12691|meno3=Christopher E.|priezvisko2=Bass|meno2=David|priezvisko=Adl|meno=Sina M.|jazyk=en|issn=1550-7408|url=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/jeu.12691|strany=4–119|číslo=1|ročník=66|dátum prístupu=2020-01-21|dátum=2019|periodikum=Journal of Eukaryotic Microbiology|priezvisko3=Lane}}</ref>
 
{| class="wikitable" cellspacing="4" style="text-align:left"
|'''<big>Superskupina</big>'''| colspan="2" |'''<big>ZaraďovanéNadradené skupiny</big>'''
|'''<big>PopisNadskupina</big>'''||'''<big>Zaraďované skupiny</big>'''
|'''<big>Opis</big>'''
|-
| rowspan="3" |Opimoda
|'''Amorphea'''||[[Meňavkovce (Amoebozoa)|Amoebozoa]], [[Opistokonty|Opisthokonta]], [[Breviatea]], [[Apusomonadida]]
| rowspan="2" |Amorphea
|Amoebozoa zahŕňajú väčšinu [[Meňavky|meňavkovitých]] organizmov a [[slizovky]]. Opistokonta sú typické zadným bičíkom a zahŕňajú známe mnohobunkové organizmy ako živočíchy či huby.
|'''[[Amoebozoa]]''' (meňavkovce)||[[Evosea]], [[Discosea]], [[Tubulinea]]
|Zahŕňa väčšinu [[Meňavky|meňavkovitých]] organizmov a [[slizovky]].
|-
|'''TSARObazoa'''
|'''CRuMs<ref>{{Citácia periodika|titul=Phylogenomics Places Orphan Protistan Lineages in a Novel Eukaryotic Super-Group|doi=10.1093/gbe/evy014|meno3=Ryoma|priezvisko2=Heiss|meno2=Aaron A.|priezvisko=Brown|meno=Matthew W.|poznámky=PMID: 29360967
|'''Amorphea'''||[[Meňavkovce (Amoebozoa)|Amoebozoa]], [[Opistokonty|Opisthokonta]], [[Breviatea]], [[Apusomonadida]]
PMCID: PMC5793813|issn=1759-6653|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29360967|strany=427–433|číslo=2|ročník=10|dátum prístupu=2020-01-21|dátum=02 01, 2018|periodikum=Genome Biology and Evolution|priezvisko3=Kamikawa}}</ref>'''
|AmoebozoaNázov zahŕňajúodkazuje väčšinuna [[Meňavky|meňavkovitých]]jej organizmovtri a [[slizovky]]súčasti. Opistokonta sú typické zadným bičíkom a zahŕňajú známe mnohobunkové organizmy ako živočíchy či huby.
|}-
|
|'''CRuMs'''<ref>{{Citácia periodika|titul=Phylogenomics Places Orphan Protistan Lineages in a Novel Eukaryotic Super-Group|doi=10.1093/gbe/evy014|meno3=Ryoma|priezvisko2=Heiss|meno2=Aaron A.|priezvisko=Brown|meno=Matthew W.|poznámky=PMID: 29360967
PMCID: PMC5793813|issn=1759-6653|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29360967|strany=427–433|číslo=2|ročník=10|dátum prístupu=2020-01-21|dátum=02 01, 2018|periodikum=Genome Biology and Evolution|priezvisko3=Kamikawa}}</ref>'''
|[[Collodictyonidae]], [[Rigifilida]], ''[[Mantamonas]]''
|Drobná skupina skupina jednobunkových organizmov, názov je slovnou hračkou.
|-
| rowspan="6" |Diphoda<ref>{{Citácia periodika|titul=Bacterial proteins pinpoint a single eukaryotic root|doi=10.1073/pnas.1420657112|meno3=Vladimír|priezvisko2=Torruella|meno2=Guifré|priezvisko=Derelle|meno=Romain|poznámky=PMID: 25646484
|'''TSAR'''
PMCID: PMC4343179|issn=1091-6490|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=diphoda+metamonata|strany=E693–699|číslo=7|ročník=112|dátum prístupu=2020-01-21|dátum=2015-02-17|periodikum=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|priezvisko3=Klimeš}}</ref>
|[[Stramenopila]], [[Alveolata]], [[Rhizaria]], [[Telonema|Telonemia]]
| rowspan="5" |Diaphoretickes
|'''Sar'''
|[[Stramenopila]], [[Alveolata]], [[Rhizaria]], [[Telonema|Telonemia]]
|Skupina združuje jadrá niekdajších skupín Protista a Chromista vrátane mnohobunkových [[Chaluhy|chalúh]].
|-
|[[Rastliny|'''Archaeplastida''']]
(rastliny)
|[[zelené rastliny|Viridiplantae]], [[červené riasy|Rhodophyta]], [[Glaucophyta|Glaucofyta]], [[Rhodephidia]]<ref>{{Citácia periodika|titul=Non-photosynthetic predators are sister to red algae|doi=10.1038/s41586-019-1398-6|meno3=Elisabeth|priezvisko2=Tikhonenkov|meno2=Denis V.|priezvisko=Gawryluk|meno=Ryan M. R.|poznámky=PMID: 31316212|issn=1476-4687|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=rhodelphidia#|strany=240–243|číslo=7768|ročník=572|dátum prístupu=2020-01-21|dátum=08 2019|periodikum=Nature|priezvisko3=Hehenberger}}</ref>
|Pravdepodobne [[Vedecká klasifikácia|monofyletický taxón]] obsahujúci mnohobunkové rastliny a ich jednobunkových príbuzných.
|-
|[[Kryptomonády|'''Cryptista''']]
(kryptomonády)
|[[Kryptomonády|Cryptomonadida]], [[Katablepharida]], ''[[Palpitomonas]]''
|[[Kryptomonády]] v širšom slova zmysle.
|-
|Ide v podstate o haptophyta rozšírené o centrohelidné slnivky.
|-
|'''Hemimastigophora'''<ref>{{Citácia periodika|titul=Hemimastigophora is a novel supra-kingdom-level lineage of eukaryotes|doi=10.1038/s41586-018-0708-8|meno3=Laura|priezvisko2=Eglit|meno2=Yana|priezvisko=Lax|meno=Gordon|poznámky=PMID: 30429611|issn=1476-4687|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30429611|strany=410–414|číslo=7736|ročník=564|dátum prístupu=2020-01-21|dátum=12 2018|periodikum=Nature|priezvisko3=Eme}}</ref>'''
|
|[[Spironemida]]
|Drobná jednobunková skupina.
|-
|
|'''''Eukaryota incertae sedis'''''
|'''[[Excavata]]'''
|[[Picozoa]], [[Ancyromonadida]], [[Discoba]], [[Metamonada]], [[Malawimonas]], [[Ancoracysta]]
(exkaváty, vykotlance<ref>{{Citácia knihy|titul=Excavata|url=https://cs.wikipedia.org/w/index.php?title=Excavata&oldid=18069954|rok=2020-01-21|jazyk=cs|poznámka=Page Version ID: 18069954}}</ref>)
|Skupiny doteraz bez zaradenia (vrátena bývalých Excavata).
|[[Discoba]], [[Metamonada]]
|}
|Organizmy s cytosómom v podobe ryhy, ktorý je typický pre prvé eukaryoty<ref>{{Citácia periodika|titul=Combined morphological and phylogenomic re-examination of malawimonads, a critical taxon for inferring the evolutionary history of eukaryotes|doi=10.1098/rsos.171707|meno3=Fleming|priezvisko2=Kolisko|meno2=Martin|priezvisko=Heiss|meno=Aaron A.|poznámky=PMID: 29765641
PMCID: PMC5936906|issn=2054-5703|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29765641|strany=171707|číslo=4|ročník=5|dátum prístupu=2020-01-21|dátum=2018-04|periodikum=Royal Society Open Science|priezvisko3=Ekelund}}</ref>. Skupina nemusí byť [[Vedecká klasifikácia|monofyletická]], Discoba a Metamonada nemusia byť sesterskými taxónmi.
|}
Aj napriek relatívne dobre zmapovaným príbuzenským vzťahom dnes mnoho skupín a rodov nedokážeme zaradiť do žiadnej nadskupiny. Sina M. Adl a jeho kolektív takéto organizmy uvádzajú mimo publikovanú klasifikáciu ako '''Eukaryota incertae sedis''', aby sa predčasne zabránilo vzniku [[Vedecká klasifikácia|polyfyletických taxónov]].<ref>{{Citácia periodika|titul=Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes|doi=10.1111/jeu.12691|meno3=Christopher E.|priezvisko2=Bass|meno2=David|priezvisko=Adl|meno=Sina M.|jazyk=en|issn=1550-7408|url=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/jeu.12691|strany=4–119|číslo=1|ročník=66|dátum prístupu=2020-01-21|dátum=2019|periodikum=Journal of Eukaryotic Microbiology|priezvisko3=Lane}}</ref>
 
== Referencie ==
{{Preklad|cs|Eukaryota|4418611}}