Základné reprodukčné číslo: Rozdiel medzi revíziami

uz len jeden odsek
Značky: Vizuálny editor sekcia Referencie
(uz len jeden odsek)
[[Súbor:Daily_R_ratio_Czech_republic_COVID-19.png|náhľad| Efektívne index nákazlivosti v SR počas [[Pandémia ochorenia COVID-19|pandémie covidu-19]] v marci 2020]]{{pracuje sa}}'''Základné reprodukčné číslo''' (tiež '''index nákazlivosti,''' skratka '''R<sub>0</sub>''' <nowiki>''basic reproduction number''</nowiki> je v [[Epidemiológia|epidemiológii]] pre konkrétne [[Infekčná choroba|infekčné ochorenie]] číslo vyjadrujúce koľko ďalších ľudí nakazí v priemere jeden infikovaný touto chorobou v populácii, kde všetci jedinci sú k tejto chorobe náchylní (tj. nemajú vytvorenú [[Imunita (biológia)|imunitu]], či už prirodzenú alebo vďaka [[Očkovanie|očkovaniu]]).<ref name="Fraser">{{Citácia periodika|titul=Pandemic Potential of a Strain of Influenza A (H1N1): Early Findings|doi=10.1126/science.1176062|meno3=S.|priezvisko2=Donnelly|meno2=C. A.|priezvisko=Fraser|meno=C.|jazyk=en|issn=0036-8075|url=https://www.sciencemag.org/lookup/doi/10.1126/science.1176062|strany=1557–1561|číslo=5934|ročník=324|dátum prístupu=2021-09-15|dátum=2009-06-19|periodikum=Science|priezvisko3=Cauchemez}}Free text</ref> Základné reprodukčné číslo udáva počiatočnú hodnotu nákazlivosti v danej populácii podľa použitého modelu, a to pred prijatím ochranných opatrení. Je to základný odhad odhad infekčnosti ochorenia.<ref name="nzip1111">[[NZIP]]: [https://www.nzip.cz/rejstrikovy-pojem/1111 Reprodukční číslo]</ref> Podľa [[Svetová zdravotnícka organizácia|Svetovej zdravotníckej organizácie]] (WHO) má ochorenie [[COVID-19]] za bežných podmienok reprodukčné číslo okolo 2,3 , čo znamená, že je to oveľa viac infekčnejší ako ako bežná chrípka, ktorá má reprodukčné číslo 1,3.<ref>{{Citácia elektronického dokumentu|titul=Hľadá sa číslo R0. Ako rýchlo sa šíri vírus na Slovensku, keď dodržiavame opatrenia, a prečo sú o to spory|url=https://dennikn.sk/1841251/hlada-sa-cislo-r0-ako-rychlo-sa-siri-virus-na-slovensku-ked-dodrziavame-opatrenia-a-preco-su-o-to-spory/|vydavateľ=Denník N|dátum vydania=2020-04-07|dátum prístupu=2021-09-14|jazyk=sk-SK|meno=Tomáš|priezvisko=Vasilko}}</ref>
 
Index nákazlivosti R<sub>0</sub> by sa nemal zamieňať s '''efektívnym reprodukčnom číslom''' (skratka '''R <sub>t),</sub>''' - '''efektívnym reprodukčnom číslom''', ktoré označuje nákazlivosť infekcie v populácii v danomkonkrétnom čase ''t'' (R s indexom ''t'' alebo '''''R<sub>e</sub>''''' s indexom ''e)'' a používa sa na sledovanie vývoja epidemiologickej situácie v už infikovanej populácii. Pre R<sub>t</sub> väčšie ako 1 počet novo nakazených (alebo noví nakazení) stúpa. Čím je R<sub>t</sub> vyššie, tým sa nákaza šíri rýchlejšie. Pre R<sub>t</sub> menšie ako 1 počet novo nakazených naopak klesá, môžeme očakávať vyhasnutia [[Epidémia|epidémie]].
 
== Charakteristika ==
Niektoré definície indexu nákazlivosti, napríklad definícia austrálskeho ministerstva zdravotníctva, k definícii dodávajú absenciu ''"akéhokoľvek úmyselného zásahu do prenosu choroby".''<ref>{{Cite web|url=https://www1.health.gov.au/internet/publications/publishing.nsf/Content/mathematical-models~mathematical-models-models.htm~mathematical-models-2.2.htm|title=Department of Health {{!}} 2.2 The reproduction number}}</ref> Z definície vyplýva, že index nákazlivosti nemožno modifikovať očkovacími kampaňami. R<sub>0</sub> je bezrozmerné číslo. Nejedná sa teda o mieru súvisiacu s jednotkou času.časom<ref>{{Cite web|url=https://web.stanford.edu/~jhj1/teachingdocs/Jones-on-R0.pdf|title=Notes On R0}}</ref> (napr. počet novo infikovaných alebo pozitívne testovaných za jeden deň) alebo čas dosiahnutia dvojitého počtu infikovaných.<ref>{{Cite web|url=https://www.forbes.com/sites/startswithabang/2020/03/17/why-exponential-growth-is-so-scary-for-the-covid-19-coronavirus/|title=Why 'Exponential Growth' Is So Scary For The COVID-19 Coronavirus}}</ref> Aj preto index R<sub>0</sub> sám o sebe neumožňuje odhadnúť, ako rýchlo sa infekcia v populácii šíri.
{| class="wikitable sortable" align="right" style="margin-left: 1em; text-align:center"
|+Index nákazlivosti niektorých známych infekčných chorôb <ref name="Smallpox">Není-li uvedeno jinak, hodnota indexu nakažlivosti je převzata z [https://stacks.cdc.gov/view/cdc/27929 History and Epidemiology of Global Smallpox Eradication]( {{Wayback|url=https://stacks.cdc.gov/view/cdc/27929|date=20160510000000}}), a module of the training course "Smallpox: Disease, Prevention, and Intervention". The CDC and the [[Svetová zdravotnícka organizácia|World Health Organization]], 2001. Slide 17. This gives sources as "Modified from ''[[Epidemiologic Reviews|Epid Rev]]'' 1993;15: 265-302, ''[[American Journal of Preventive Medicine|Am J Prev Med]]'' 2001; 20 (4S): 88-153, ''[[Morbidity and Mortality Weekly Report|MMWR]]'' 2000; 49 (SS-9); 27-38"</ref>
! choroba
! spôsob prenosu
! R <sub>0</sub>
|-
| [[osýpky]]
| vzduchom
| 12-18 <ref>{{Citácia periodika|doi=10.1016/S1473-3099(17)30307-9|url=https://www.thelancet.com/journals/laninf/article/PIIS1473-3099(17)30307-9/fulltext|issn=1473-3099}}</ref>
|-
| [[ovčie kiahne]]
| vzduchom
| 10-12
|-
| [[Zápal príušných žliaz|mumps]]
| kvapôčkami
| 10-12
|-
| [[detská obrna]]
| fekáliami, slinami
| 5-7
|-
| [[Ružienka|rubeola]]
| kvapôčkami
| 5-7
|-
| [[čierny kašeľ]]
| kvapôčkami
| 5,5 <ref>{{Citácia periodika|doi=10.1371/journal.pmed.1000291}}</ref>
|-
| [[Kiahne|pravé kiahne]]
| kvapôčkami
| 3,5-6 <ref>{{Citácia periodika|doi=10.1038/414748a|url=https://www.nature.com/articles/414748a|issn=1476-4687}}</ref>
|-
| [[Syndróm získanej imunitnej nedostatočnosti|HIV / AIDS]]
| telesnými tekutinami
| 2-5
|-
| [[SARS]]
| kvapôčkami
| 2-5
|-
| záškrt
| slinami
| 1,7-4,3 <ref>{{Citácia periodika|doi=10.1093/cid/ciz808|url=https://academic.oup.com/cid/advance-article-abstract/doi/10.1093/cid/ciz808/5551532?redirectedFrom=fulltext}}</ref>
|-
| [[COVID-19|covid-19]]
| kvapôčkami
| 1,4-3,9 <ref>{{Citácia periodika|doi=10.1056/NEJMoa2001316}}</ref> <ref>{{Citácia periodika|doi=10.2807/1560-7917.ES.2020.25.4.2000058}}</ref> <ref>{{Citácia periodika|doi=10.1101/2020.01.25.919787}}</ref> <ref>{{Citácia periodika|doi=10.1101/2020.01.23.20018549}}</ref> <ref>{{Citácia periodika|url=https://www.nature.com/articles/s41591-020-0822-7|doi=10.1038/s41591-020-0822-7|issn=1546-170X}}</ref>
|-
| [[chrípka]]<br /><br /><br /><br /><nowiki></br></nowiki> <small>( [[Španielska chrípka]], 1918-1920)</small>
| kvapôčkami
| 1,4-2,8 <ref>{{Citácia periodika|doi=10.1038/nature04795}}</ref>
|-
| [[Choroba vyvolaná vírusom Ebola|ebola]]<br /><br /><br /><br /><nowiki></br></nowiki> <small>( [[Epidémia eboly v západnej Afrike v rokoch 2013 až 2016|Epidémie v západnej Afrike]], 2013-2016)</small>
| telesnými tekutinami
| 1,5-2,5 <ref>{{Citácia periodika|doi=10.1371/currents.outbreaks.91afb5e0f279e7f29e7056095255b288}}</ref>
|-
| [[chrípka]]<br /><br /><br /><br /><nowiki></br></nowiki> <small>( [[Chrípková pandémia v roku 2009|Mexická prasacia chrípka]], 2009-2010)</small>
| kvapôčkami
| 1,4-1,6 <ref name="Coburn2009">{{Citácia periodika|doi=10.1186/1741-7015-7-30}}</ref>
|-
| [[chrípka]]<br /><br /><br /><br /><nowiki></br></nowiki> <small>(sezónne epidémie)</small>
| kvapôčkami
| 0,9-2,1 <ref name="Coburn2009" />
|-
| MERS
| kvapôčkami
| 0,3-0,8 <ref>{{Citácia periodika|doi=10.2807/1560-7917.ES2015.20.25.21167}}</ref>
|}
 
Index nákazlivosti nie je pre [[patogén]] biologická [[konštanta]], pretože je ovplyvňovaný ďalšími faktormi, ako vhodnosť prostredieprostredia pre šírenie patogénu a správanie infikovanésa infikovanej populácie. Hodnoty R <sub>0</sub> sa obvykle odhadujú z matematických modelov a bývajú preto závislé od použitého modelu a hodnotáchhodnôt ďalších použitých parametrov. Hodnoty uvádzané v literatúre teda majú zmysel len v danom kontexte (modelu). Neodporúča sa preto používať zastarané hodnoty alebo porovnávať hodnoty založenejzaložené na rôznych modeloch. <ref>{{Citácia periodika|titul=Complexity of the Basic Reproduction Number (R 0 )|url=http://wwwnc.cdc.gov/eid/article/25/1/17-1901_article.htm|periodikum=Emerging Infectious Diseases|dátum=2019-01|dátum prístupu=2021-09-15|ročník=25|číslo=1|strany=1–4|issn=1080-6040|doi=10.3201/eid2501.171901|issnmeno=1080-6040Paul L.|priezvisko=Delamater|meno2=Erica J.|priezvisko2=Street|meno3=Timothy F.|priezvisko3=Leslie}}</ref> Index R <sub>0</sub> sám o sebe nedáva odhad, ako rýchlo sa infekcia šíri v populácii. Reprodukčné číslo má zmysel iba pre populačné skupiny, v ktorej sa epidémia reálne šíri. V situácii, keď existujú len lokálne ohniská a vo zvyšku populácie, či štátu sa ochorenie prakticky nevyskytuje, neposkytuje celkové R<sub>0</sub> v podstate žiadnu validnýhodnovernú informáciu. <ref name="nzip1111">[[NZIP]]: [https://www.nzip.cz/rejstrikovy-pojem/1111 Reprodukční číslo]</ref>
== Odtiaľto nedorobené - asi vymazať tabuľku ==
Index nákazlivosti nie je pre [[patogén]] biologická [[konštanta]], pretože je ovplyvňovaný ďalšími faktormi, ako vhodnosť prostredie pre šírenie patogénu a správanie infikované populácie. Hodnoty R <sub>0</sub> sú obvykle odhadujú z matematických modelov a bývajú preto závislé od použitého modelu a hodnotách ďalších použitých parametrov. Hodnoty uvádzané v literatúre teda majú zmysel len v danom kontexte. Neodporúča sa preto používať zastarané hodnoty alebo porovnávať hodnoty založenej na rôznych modeloch. <ref>{{Citácia periodika|doi=10.3201/eid2501.171901|issn=1080-6040}}</ref> Index R <sub>0</sub> sám o sebe nedáva odhad, ako rýchlo sa infekcia šíri v populácii. Reprodukčné číslo má zmysel iba pre populačné skupiny, v ktorej sa epidémia reálne šíri. V situácii, keď existujú len lokálne ohniská a vo zvyšku populácie či štátu sa ochorenie prakticky nevyskytuje, neposkytuje celkové R v podstate žiadnu validný informáciu. <ref name="nzip1111">[[NZIP]]: [https://www.nzip.cz/rejstrikovy-pojem/1111 Reprodukční číslo]</ref>
 
Index nákazlivosti R <sub>0</sub> sa používa predovšetkým pri určovaní, či sa novo objevivšíobjavené infekčné ochorenie môže rozšíriť v populácii, a aký podiel populácie by mal byť imunizovaný [[Očkovanie|očkovaním]] kpre eradikáciu ochoreníochorenia (pozri [[kolektívna imunita]]). V bežne používaných modeloch platí, že keď je R <sub>0></sub>> 1, infekcia má potenciál začať sa šíriť v populácii. Všeobecne platí, že čím vyššia je hodnota R <sub>0,</sub> tým ťažšie je udržať potenciálnypotenciálnu [[Epidémia|epidémiu]] pod kontrolou. U jednoduchých modelov platí, že podiel populácie, ktorá musí byť účinne imunizovanéimunizovaná (tj. Žeže nebude už ďalej náchylná k infekcii), aby sa zabránilo trvalému šíreniu infekcie, musí byť zaočkovanosť väčšia ako ''Prah kolektívnej imunity (HIT)'' čo je 1 - 1 / R <sub>0.</sub> <ref>{{Citácia periodika|titul="Herd Immunity": A Rough Guide|doi=10.1093/cid/cir007|meno3=D. L.|priezvisko2=Eames|meno2=K.|priezvisko=Fine|meno=P.|jazyk=en|issn=1058-4838|url=https://academic.oup.com/cid/article-lookup/52/7/911/299077|doi=/10.1093/cid/cir007|issnstrany=1058911–916|číslo=7|ročník=52|dátum prístupu=2021-483809-15|dátum=2011-04-01|periodikum=Clinical Infectious Diseases|priezvisko3=Heymann}}</ref> Naopak, podiel populácie, ktorá zostáva náchylná k infekcii v endemickej rovnováhe, je 1 / R <sub>0.</sub>
 
Index nákazlivosti je ovplyvňovaný rôznymi faktormi, ako dobanapríklad nákazlivostitrvanie chorých[[Inkubačná lehota (medicína)|inkubačnej doby]], infekčnosť organizmumikroorganizmov (množstvo organizmom ďalej šírených patogénov) a počet náchylných ľudí v populácii, s ktorými sú nakazení v kontakte.
 
== Odtiaľto nedorobené - odstranil som tabulku - a je v článku kolektivna imunity, ani som nevkladal obrazky ==
== metódy odhadu ==
 
== metódyMetódy odhadu ==
Počas epidémie je zvyčajne známy počet pozitívne diagnostikovaných prípadov <math>N(t)</math> za čas <math>t</math> . V počiatkoch epidémie je rast prípadov exponenciálny, pričom rýchlosť rastu je logaritmická:
 
<math>n_E</math> je počet jedincov v období expozície a <math>n_I</math> počet jedincov v období latencie. <math>K</math> je logaritmické miera rastu spomínaná vyššie.
 
== Externé odkazy ==
 
* [https://korona.gov.sk/koronavirus-na-slovensku-v-cislach/ (Efektívne) Reprodukčné číslo COVID na korona.gov.sk (napr. v septembri 2021 1,05 až 1,15)]
 
=== Referencie ===
{{Preklad|en|Basic reproduction number|947266097}}
[[Kategória:Infekčné choroby]]
6 917

úprav