Základné reprodukčné číslo: Rozdiel medzi revíziami

[[Súbor:Daily_R_ratio_Czech_republic_COVID-19.png|náhľad| Efektívne index nákazlivosti v SR počas [[Pandémia ochorenia COVID-19|pandémie covidu-19]] v marci 2020]]{{pracuje sa}}'''Základné reprodukčné číslo''' (tiež '''index nákazlivosti,''' skratka '''R₀''' <nowiki>''basic reproduction number''</nowiki> je v [[Epidemiológia|epidemiológii]] pre konkrétne [[Infekčná choroba|infekčné ochorenie]] číslo vyjadrujúce koľko ďalších ľudí nakazí v priemere jeden infikovaný touto chorobou v populácii, kde všetci jedinci sú k tejto chorobe náchylní (tj. nemajú vytvorenú [[Imunita (biológia)|imunitu]], či už prirodzenú alebo vďaka [[Očkovanie|očkovaniu]]).<ref name="Fraser">{{Citácia periodika|titul=Pandemic Potential of a Strain of Influenza A (H1N1): Early Findings|doi=10.1126/science.1176062|meno3=S.|priezvisko2=Donnelly|meno2=C. A.|priezvisko=Fraser|meno=C.|jazyk=en|issn=0036-8075|url=https://www.sciencemag.org/lookup/doi/10.1126/science.1176062|strany=1557–1561|číslo=5934|ročník=324|dátum prístupu=2021-09-15|dátum=2009-06-19|periodikum=Science|priezvisko3=Cauchemez}}</ref> Základné reprodukčné číslo udáva počiatočnú hodnotu nákazlivosti v danej populácii podľa použitého modelu, a to pred prijatím ochranných opatrení. Je to základný odhad odhad infekčnosti ochorenia.<ref name="nzip1111">[[NZIP]]: [https://www.nzip.cz/rejstrikovy-pojem/1111 Reprodukční číslo]</ref> Podľa [[Svetová zdravotnícka organizácia|Svetovej zdravotníckej organizácie]] (WHO) má ochorenie [[COVID-19]] za bežných podmienok reprodukčné číslo okolo 2,3 , čo znamená, že je to oveľa viac infekčnejší ako ako bežná chrípka, ktorá má reprodukčné číslo 1,3.<ref>{{Citácia elektronického dokumentu|titul=Hľadá sa číslo R0. Ako rýchlo sa šíri vírus na Slovensku, keď dodržiavame opatrenia, a prečo sú o to spory|url=https://dennikn.sk/1841251/hlada-sa-cislo-r0-ako-rychlo-sa-siri-virus-na-slovensku-ked-dodrziavame-opatrenia-a-preco-su-o-to-spory/|vydavateľ=Denník N|dátum vydania=2020-04-07|dátum prístupu=2021-09-14|jazyk=sk-SK|meno=Tomáš|priezvisko=Vasilko}}</ref>

Počas epidémie je zvyčajne známy počet pozitívne diagnostikovaných prípadov (u nás používaná miera je počet pozitívne testovaných<ref>{{Citácia elektronického dokumentu|titul=Koronavírus na Slovensku v číslach|url=https://korona.gov.sk/koronavirus-na-slovensku-v-cislach/|vydavateľ=Koronavírus a Slovensko|dátum prístupu=2021-09-15|jazyk=sk-SK}}</ref>) <math>N(t)</math> zav časčase <math>t</math> . V počiatkoch epidémie je rast prípadov exponenciálny, pričom rýchlosť rastu je logaritmická:

Keďže ide o exponenciálny rast, <math>N</math> môže byť interpretované ako kumulatívny počet pozitívne diagnostikovaných prípadov (vrátane osôb, ktoré sa úspešne vyliečili) alebo ako aktuálny počet diagnostikovaných pacientov;. logaritmickéLogaritmická miera rastu je rovnaká pre obidve definíciemožnosti. prePre výpočet <math>R_0</math> je následne potrebné odhadnúť dobu medzi vystaveníminfikovaním sa infekcii a diagnózoudiagnostikovaním onemocnenia a dobutiež medzitrvaním vystavenímpokiaľ sa infekcii a okamihom, kedy nakazená osoba začne infekciu sama šíriť ďalej.

# Expozícia: jedinec je nakazený, nevykazuje [[Symptóm (medicína)|symptómy]], a nie je zatiaľ nákazlivý (neprenáša infekcii). Doba expozície je <math>\tau_E</math> .

# Izolácia po diagnostikovaní: jedinec je stále nákazlivý, ale sú prijaté opatrenia (napríklad umiestnením nakazenénakazenej osoby do izolácie = [[karanténa]]), aby sa infekcia ďalej nešírila.

VTento modelimodel Seirsa možnonazýva SEIR (ang. ('''S'''usceptible, '''E'''xposed, '''I'''nfectious, '''R'''ecovered) a <math>R_0</math> možno vyjadriť nasledovným vzorcom: <ref>{{Citácia periodika|doititul=Transmission Dynamics and Control of Severe Acute Respiratory Syndrome|url=https://www.sciencemag.org/lookup/doi/10.1126/science.1086616|periodikum=Science|dátum=2003-06-20|dátum prístupu=2021-09-15|ročník=300|číslo=5627|strany=1966–1970|issn=0036-8075|doi=10.1126/science.1086616|jazyk=en|meno=M.|priezvisko=Lipsitch}}</ref>

Táto metóda odhadu bola aplikovaná na [[COVID-19|covid-19]] a [[SARS]] . <ref>{{Citácia periodika|url=https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.27.20018952v1|doi=10.1101/2020.01.27.20018952v1}}</ref> Ide o riešenie diferenciálnej rovnice:

kde <math>n_E</math> je počet jedincov v období expozície a <math>n_I</math> počet jedincov v období latencie. <math>K</math> je logaritmické miera rastu spomínanáktorá je vo vzorci na výpočet <math>R_0</math> uvedené vyššie.