Špeciálnym druhom vírusov boli v minulosti tzv. [[Boot vírus]]y, ktoré namiesto bežných programov napádali miesto na nosiči dát, z ktorého sa dá zaviesť [[operačný systém]]. Najčastejšie sa prenášal pri zabudnutí [[disketa|diskety]] v [[disketová jednotka|disketovej jednotke]] pri zapínaní počítača. V dnešnej dobe už tento druh vírusov prakticky vymizol.
Ďalším špeciálnym druhom vírusov sú [[Makro vírus]]y, rozšírené najmä v prostredí kancelárskeho balíka [[Microsoft Office|MS Office]] (Word, Excel, PowerPoint, Outlook...), prípadne aj v iných, menej rozšírených programoch. Do softvéru bola pridaná možnosť vytvárať „makrá“ – malé programy zahrnuté v dokumentoch, ktoré mali pôvodne slúžiť na automatizáciu často vykonávaných krokov. [[Programovací jazyk|Jazyk]] tvorby makier však umožňuje zahrnúť do nich aj potenciálne nebezpečné operácie ako napr. zápis na disk. Otvorením dokumentu, ktorý obsahuje makro vírus, sa telo vírusu najčastejšie skopíruje do šablóny „normal“, z ktorej sa vytvárajú všetky nové dokumenty. Každý nový dokument, ktorý potom vytvoríte, je napadnutý makro vírusom. Našťastie novšie balíky Office na prítomnosť makra upozorňujú a ich dôveryhodnosť sa dá zabezpečiť napríklad [[digitálny podpis|digitálnym podpisom]], pomocou ktorého sa dá zistiť, kto makro vytvoril.
Podobným druhom sú i vírusy napísané pomocou [[skript (informatika)|skriptovacích]] jazykov, ako je jazyk [[VBScript]] alebo WSH ([[Windows Scripting Host]]). VBScript bol podobne ako makrá pridaný do kancelárskeho balíka Office. Jazyk WSH bol zasa vytvorený na uľahčenie práce správcom systémov Windows.
Účinky nákazy počítača vírusom (alebo inými druhmi malware, ako sú trójske kone, červy atď.) sú rozličné - od vypísania "vtipných" textov až po zničenie dát uložených na [[pevný disk|diskoch]] alebo ich odoslanie záškodníkovi prostredníctvom Internetu - podľa toho, čo autor vírusu v ňom implementuje.
