Lyzidín (nukleozid): Rozdiel medzi revíziami

{{Infobox Chemická zlúčenina|Názov=Lyzidín|Obrázok=Lysidine.svg|Vzorec={{chem|C|15|H|25|N|5|O|6}}|Molárna hmotnosť=371,39 g/mol|CAS=144796-96-3|Synonymá=2-lyzyl-cytidín}}

'''Lyzidín''' je nezvyčajný [[nukleozid]], ktorý sa málokedy vyskytuje mimo [[tRNA]]. Je to derivát [[cytidín]]u, ktorého karbonylová skupina bola nahradená za [[aminokyselina|aminokyselinu]] [[lyzín]]. Tretia pozícia [[antikodón]]u tRNA špecifickej pre [[izoleucín]] je typicky zamenená z [[cytozín]]u (ktorý by sa pároval s [[guanozín]]om) za lyzidín (ktorý sa páruje s [[adenozín]]om). [[Uridín]] na tejto pozícii nie je možné použiť, i keď sa bežne páruje s adenozínom, pretože pri [[wobble párovanie báz|wobble párovaní báz]] sa takisto páruje s guanozínom. Lyzidín teda umožňuje presnejšiu transláciu.<ref>{{cite journal|title=Structural basis for lysidine formation by ATP pyrophosphatase accompanied by a lysine-specific loop and a tRNA-recognition domain|name-list-style=vanc|bibcode=2005PNAS..102.7487N|first7=O|last7=Nureki|first6=T|last6=Suzuki|first5=Y|last5=Sekine|first4=A|last4=Soma|author3=Ikeuchi Y|journal=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.|author2=Fukai S|author1=Nakanishi K|display-authors=3|doi=10.1073/pnas.0501003102|pmc=1140429|pmid=15894617|date=May 2005|pages=7487–7492|issue=21|volume=102|doi-access=free}}</ref><ref>{{cite journal|journal=J Biol Chem|title=The Catalytic Flexibility of tRNAIle-lysidine Synthetase Can Generate Alternative tRNA Substrates for Isoleucyl-tRNA Synthetase|date=Apr 10, 2009|volume=284|issue=15|vauthors=Salowe SP, Wiltsie J, Hawkins JC, Sonatore LM|pages=9656–9662|pmid=19233850|doi=10.1074/jbc.M809013200|pmc=2665086|doi-access=free}}</ref> Lyzidín sa označuje písmenom '''L'''<ref>{{Citácia periodika|titul=Structural basis for translational fidelity ensured by transfer RNA lysidine synthetase|doi=10.1038/nature08474|meno3=Satoshi|priezvisko2=Bonnefond|meno2=Luc|priezvisko=Nakanishi|meno=Kotaro|jazyk=en|issn=1476-4687|url=https://www.nature.com/articles/nature08474|strany=1144–1148|číslo=7267|ročník=461|dátum prístupu=2022-01-21|dátum=2009-10|periodikum=Nature|priezvisko3=Kimura}}</ref> alebo ako '''k²C'''<ref>{{Citácia periodika|titul=Conformational Preferences of Hypermodified Nucleoside Lysidine (k²C) Occurring at “Wobble” Position in Anticodon Loop of tRNA Ile|url=https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/15257770802341475|periodikum=Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids|dátum=2008-09-19|dátum prístupu=2022-01-21|ročník=27|číslo=10-11|strany=1158–1174|issn=1525-7770|doi=10.1080/15257770802341475|jazyk=en|meno=Kailas D.|priezvisko=Sonawane|meno2=Ravindra|priezvisko2=Tewari}}</ref> (lyzín viazaný na C2 atóm cytidínu).