Roku [[1906]] kandydovalkandidoval do uhorského snemu za Ružomberok. Jeho hlavným kortešom bol [[Andrej Hlinka]], ale podporiť ho prišiel aj poslanec uhorského snemu [[František Jehlička]]. Voľby dopadli v jeho neprospech. Hlinka, Šrobár spolu s niekoľkými najaktívnejšími prívržencami čelili obvineniu z podnecovania proti maďarskej národnosti. Proces proti Hlinkovi a spol. prebiehal v Ružomberku od 26. novembra do 6. decembra 1906, Hlinku odsúdili na 2 roky štátneho väzenia, Šrobára na 1 rok, niekoľkých ďalších na kratšie tresty.<ref>Sv. Hurban Vajanský, Ružomberský kriminálny proces proti Andrejovi Hlinkovi a spoločníkom (Turč. Sv. Martin 1906)</ref>
Po odpykaní trestu v Segedíne sa Šrobár vrátil do Ružomberka. Po vypuknutí 1. sv. vojny aktívne spolupracoval s českou Maffiou.