Endopeptidáza
Endopeptidáza[1] je proteolytická peptidáza, ktorá štiepi peptidové väzby medzi aminokyselinami vnútri bielkovinového reťazca.[1][2] Popri endopeptidázach existujú exopeptidázy, ktoré štiepia peptidové väzby na jednotlivých koncoch reťazca.[1] Z tohto dôvodu nevedia endopeptidázy štiepiť peptidy a bielkoviny na monomérne jednotky (aminokyseliny), zatiaľ čo exopeptidázy áno. Špeciálnym prípadom endopeptidázy je oligopeptidáza, ktorej strubstrátom sú oligopeptidy namiesto celých bielkovín.
![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/74/PDB_2sta_EBI.jpg/220px-PDB_2sta_EBI.jpg)
Väčšina endopeptidáz štiepi špecifické väzby za alebo pred konkrétnymi aminokyselinami. Táto špecificita môže byť rôzna, čo umožňuje postupné štiepenie celého proteínu.[1] Medzi príklady endopeptidáz patria:
- Trypsín[1] - štiepi za Arg alebo Lys, ak za nimi nenasleduje Pro. Veľmi striktný, optimálne pH je 8.
- Chymotrypsín[1] - štiepi za Trp,[chýba zdroj] Phe alebo Tyr, ak za nimi nenasleduje Pro. Štiepi pomalšie po His, Met alebo Leu.[chýba zdroj] Optimálne pH je 8.
- Elastáza[1] - štiepi za neutrálnymi aminokyselinami, ak ich nenasleduje Pro.
- Pepsín[1] - štiepi pred Leu, Trp,[chýba zdroj] Phe alebo Tyr, ak sa pred nimi nenachádza Pro. Optimálne pH je 2.
- Enteropeptidáza, enterokináza[1] - štiepi trypsinogén, konkrétne za karboxylovou skupinou Lys v počiatočnej sekvencii DDDDKX.[3]
- Termolyzín - štiepi pred Ile, Met, Phe, Trp, Tyr alebo Val, ak sa pred nimi nenachádza Pro. Niekedy štiepi za Ala, Asp, His alebo Thr.[chýba zdroj]
Referencie
upraviť- ↑ a b c d e f g h i ŠKÁRKA, Bohumil; FERENČÍK, Miroslav. Biochémia. 3. vyd. [s.l.] : [s.n.], 1992. ISBN 80-05-01076-1. S. 360, 688.
- ↑ endopeptidase [online]. Merriam-Webster. Dostupné online. Archivované 2017-01-18 z originálu.
- ↑ TERPE, K.. Overview of tag protein fusions: from molecular and biochemical fundamentals to commercial systems. Applied Microbiology and Biotechnology, 2003-01, roč. 60, čís. 5, s. 523–533. Dostupné online [cit. 2022-04-09]. ISSN 0175-7598. DOI: 10.1007/s00253-002-1158-6. (po anglicky)
Zdroj
upraviťTento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Endopeptidase na anglickej Wikipédii.