Molekulová dynamika

Molekulová dynamika (MD) je počítačová simulačná metóda, ktorá simuluje klasický pohyb atómov v danom silovom poli.

Pôvodne sa molekulová dynamika používala na výskum relaxačných javov a transportných vlastností kvapalín. Neskôr sa zistilo, že MD simulácie môžu byť účinnou metódou výpočtov štruktúrnych a termodynamických vlastností komplexných kvapalín, tekutých solí, kryštálov, polymérov a proteínov v roztoku.[1] Vývoj molekulovodynamických simulácií urýchlil rozvoj počítačovej techniky a MD metód. V súčasnosti sa bežne uskutočňujú MD simulácie systémov veľkosti enzýmov, ktoré sú obklopené tisíckami molekúl vody.[2]

Referencie

upraviť
  1. Haile, J. M. Molecular Dynamics Simulation. Elementary Methods. Wiley, New York, 1992.
  2. Wu, N. Encyclopedia of Molecular Dynamics, Callisto Reference 2015. ISBN 978-1632392756

Iné projekty

upraviť