Transsulfuračná cesta

Transsulfuračná cesta[1] alebo jednoducho transsulfurácia[1][2][3] je metabolická dráha, ktorej úlohou je premena cysteínu na homocysteín alebo naopak. V procese vzniká cystationín. Existujú dve transsulfuračné cesty, a to v smere cysteín → homocysteín a v smere homocysteín → cysteín.[4]

Transsulfuračná cesta, konkrétne v smere od homocysteínu k cysteínu (v spodnej časti). Homocysteín sa premieňa na cystationín (5) a potom na cysteín (6). Reakciu 5 katalyzuje cystationín β-syntáza a reakciu 6 cystationín γ-lyáza. Homocysteín vzniká z metionínu reakciami 1, 2 a 3.

Proces upraviť

Cysteín → homocysteín upraviť

Táto dráha je prítomná v niekoľkých druhoch baktérií, napríklad Escherichia coli[5] a Bacillus subtilis.[6] Spočíva v prenose tiolovej skupiny z cysteínu na homocysteín, čo je prekurzor metionínu. Táto zmena prebieha vďaka reakcii cysteínu s aktivovaným homoserínom, čím vzniká cystationín a sukcinát alebo acetát v reakcii katalyzovanej cystationín γ-syntázou (kódovaná génom metB v E. coli a metI s bifunkčnouaktivitou v B. subtilis). Cystationín potom podlieha β-eliminácii homocysteínu a zostáva z neho nestabilná iminokyselina, z ktorej reakciou s vodou vzniká pyruvát a amoniak. Celú túto reakciu katalyzuje cystationín β-lyáza.[7] Homocysteín, ktorý vzniká touto dráhou, potom možno premeniť na metionín metylačnou reakciou, ktorú katalyzuje metionínsyntáza.

Homocysteín → cysteín upraviť

V niektorých organizmoch, vrátane ľudí, je prítomná opačná dráha, ktorá spočíva v prenose tiolovej skupiny z homocysteínu na cysteín podobným mechanizmom. V Klebsiella pneumoniae je cystationín β-syntáza kódovaná génom mtcB, zatiaľ čo γ-lyáza je kódovaná mtcC.[8] Ľudia sú auxotrofné organizmy, ktoré musia prijímať metionín z potravy, preto sa metionín nazýva esenciálnou aminokyselinou, ale nemusia prijímať cysteín práve vďaka tejto transsulfuračnej dráhe. Existujú však poruchy tejto dráhy, ktoré vznikajú ako mutácie v enzýmoch, ktoré vedú k homocystinúrii (kvôli akumulácii homocysteínu) a iným poruchám.

Úloha pyridoxalfosfátu upraviť

Všetky štyri transsulfuračné enzýmy (cystationín β-syntáza, cystationín γ-syntáza, cystationín β-lyáza a cystationín γ-lyáza) vyžadujú vitamín B6 v jeho aktívnej forme (pyridoxalfosfát, PLP). Tri z týchto enzýmov (všetky okrem cystationín β-syntázy) sú súčasťou PLP-dependentnej rodiny enzýmov Cys/Met metabolizmu (PLP enzýmy typu I). Existuje päť rôznych štruktúrne príbuzných druhov PLP enzýmov. Do tejto rodiny, ktorá je typu I, patria:[9]

  • V biosyntéze metionínu:
  • V biosyntéze cysteínu:
    • v transsulfuračnej ceste:
    • v priamej sulfurylačnej dráhe:
  • V rozklade metionínu:

Gény metC, metB a metZ sú si blízko príbuzné a v NCBI patria pod klaster ortológov (COG0626).[11] Podľa aktuálnych znalostí by sa metC mal vždy nachádzať spolu s metB (pretože metB tvorí produkt, ktorý je ďalej premieňaný pôsobením metC), ale existujú organizmy, ktoré majú len metC. To naznačuje buď bifunkčnú úlohu metC, ktorá však nebola dokázaná u žiadneho organizmu, alebo niektoré enzýmy kódované metY dokážu katalyzovať tú istú reakciu ako metB, čo však nebolo poriadne preskúmané.[9] U niektorých organizmov, napr. B. subtilis, zastáva úlohu metB bifunkčný enzým metI.[9]

Priama sulfurácia upraviť

Priama sulfurylačná dráha na syntézu cysteínu alebo homocysteínu prebieha výmenou acetylovej/sukcinylovej skupiny za sulfid (gény cysK a cysM kódujú cysteínsyntázu[12] a gény metY a metZ kódujú homocysteínsyntázu[13]).

Referencie upraviť

  1. a b Význam a možnosti stanovenia vitamínu B12, vitamínu B6 a kyseliny listovej pri poruche metabolizmu homocysteínu | Unilabs [online]. www.unilabs.sk, [cit. 2022-07-31]. Dostupné online.
  2. KRAJČOVIČOVÁ-KUDLÁČKOVÁ, M. NUTRIČNÉ DETERMINANTY HOMOCYSTEINÉMIE [online]. www.prolekare.cz, [cit. 2022-07-31]. Dostupné online. (po česky)
  3. Je konzumácia mäsa škodlivá? Sírovodík, sulfát a mikrobióm. [online]. jaroslavlachky.sk, [cit. 2022-07-31]. Dostupné online.
  4. Weekley, C. M. and Harris, H. H.. Which form is that? The importance of selenium speciation and metabolism in the prevention and treatment of disease. Chem. Soc. Rev., 2013, s. 8870–8894. DOI10.1039/c3cs60272a. PMID 24030774.
  5. The enzymes of the transsulfuration pathways: Active-site characterizations. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics, 2011, s. 1511–7. DOI10.1016/j.bbapap.2011.03.006. PMID 21435402.
  6. The metIC operon involved in methionine biosynthesis in Bacillus subtilis is controlled by transcription antitermination. Microbiology, 2002, s. 507–518. DOI10.1099/00221287-148-2-507. PMID 11832514.
  7. Crystal Structure of the Pyridoxal-5′-phosphate Dependent Cystathionine β-lyase fromEscherichia coliat 1.83 Å. Journal of Molecular Biology, 1996, s. 202–224. DOI10.1006/jmbi.1996.0508. PMID 8831789.
  8. Two Transsulfurylation Pathways in Klebsiella pneumoniae. Journal of Bacteriology, 2006, s. 5762–5774. DOI10.1128/JB.00347-06. PMID 16885444.
  9. a b c Bacterial methionine biosynthesis. Microbiology, 2014, s. 1571–84. DOI10.1099/mic.0.077826-0. PMID 24939187.
  10. ELIOT, Andrew C.; KIRSCH, Jack F.. Pyridoxal Phosphate Enzymes: Mechanistic, Structural, and Evolutionary Considerations. Annual Review of Biochemistry, 2004-06, roč. 73, čís. 1, s. 383–415. Dostupné online [cit. 2022-07-31]. ISSN 0066-4154. DOI10.1146/annurev.biochem.73.011303.074021. (po anglicky)
  11. COG0626 - NCBI [online]. www.ncbi.nlm.nih.gov, [cit. 2022-07-31]. Dostupné online.
  12. Structure and Mechanism of O-Acetylserine Sulfhydrylase. Journal of Biological Chemistry, 2004, s. 26803–26806. DOI10.1074/jbc.R400001200. PMID 15073190.
  13. Corynebacterium glutamicum utilizes both transsulfuration and direct sulfhydrylation pathways for methionine biosynthesis. Journal of Bacteriology, 2002, s. 1277–1286. DOI10.1128/JB.184.5.1277-1286.2002. PMID 11844756.

Zdroj upraviť

Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Transsulfuration pathway na anglickej Wikipédii.