Krotonylkoenzým A
Krotonylkoenzým A (krotonyl-CoA) je intermediát vo fermentácii kyseliny maslovej a v metabolizme lyzínu a tryptofánu.[1][2][3] Je to dôležitá látka, ktorá vystupuje v metabolizme mastných kyselín a aminokyselín.[4] Skladá sa z kyseliny krotónovej viazanej na koenzým A.
| Krotonylkoenzým A | |
 | |
| Všeobecné vlastnosti | |
| Sumárny vzorec | C25H40N7O17P3S |
| Systematický názov | kyselina [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purín-9-yl)-4-hydroxy-3-(fosfónooxy)oxolán-2-yl]metyl-(3R)-4-({3-[(2-{[(2E)-but-2-enoyl]sulfanyl}etyl)amino]-3-oxopropyl}amino)-3-hydroxy-2,2-dimetyl-4-oxobutyldihydrogéndifosforečná |
| Synonymá | krotonyl-CoA |
| Fyzikálne vlastnosti | |
| Molárna hmotnosť | 835,609 g/mol |
| Ďalšie informácie | |
| Číslo CAS | 992-67-6 |
| PubChem | 592 |
| ChemSpider | 444072 |
| SMILES | CC=CC(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)C(C(C)(C)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC1C(C(C(O1)N2C=NC3=C(N=CN=C32)N)O)OP(=O)(O)O)O |
| 3D model (JSmol) | Interaktívny 3D model |
| Pokiaľ je to možné a bežné, používame jednotky sústavy SI. Ak nie je hore uvedené inak, údaje sú za normálnych podmienok. | |
Metabolizmus
upraviťMetabolizmus aminokyselín
upraviťV metabolizme lyzínu a tryptofánu vzniká krotonyl-CoA z glutakonyl-CoA pôsobením dekarboxylázy:[2][3]
- glutakonyl-CoA → krotonyl-CoA + CO2
Krotonyl-CoA sa potom hydratuje za vzniku 3-hydroxybutyryl-CoA pôsobením enoyl-CoA-hydratázy:[2][3]
- krotonyl-CoA + H2O → 3-hydroxybutyryl-CoA
Metabolizmus mastných kyselín
upraviťKrotonyl-CoA vzniká i v rozklade mastných kyselín, teda beta-oxidácii. Počas nej dochádza k postupnému skracovaniu reťazca lineárnych nasýtených mastných kyselín pomocou dehydrogenácie, hydratácie, oxidácie a štiepenia reťazca, čím vznikajú jednotky acetyl-CoA. V poslednom cykle, kedy sa štiepi butyryl-CoA, vzniká dehydrogenáciou krotonyl-CoA, ktorý sa hydratáciou premieňa na 3-hydroxybutyryl-CoA.[3]
Fermentačné procesy
upraviťU niektorých mikroorganizmov, napríklad Clostridium kluyveri, je krotonyl-CoA produktom fermentačnej dráhy.[5][6][7] Výsledným produktom tohto procesu je butanoát.[6][7] Tento proces sa označuje ako Weizmannov proces.
Reduktázy
upraviťPred rokom 2007 boli známe krotonyl-CoA karboxylázy a reduktázy (CCR), ktoré redukovali krotonyl-CoA na butyryl-CoA. Potom Alber a jeho spolupracovníci publikovali štúdiu, v ktorej usúdili, že konkrétny CCR homológ umožňuje redukciu krotonyl-CoA na (2S)-etylmalonyl-CoA, čo bola výhodná reakcia. Tento homológ pochádzal z baktérie Rhodobacter sphaeroides.[8]
Úloha v transkripcii
upraviťPosttranslačné úpravy histónov acetyláciou alebo krotonyláciou sú dôležité pre aktívnu transkripciu génov. Krotonylácia histónov je regulovaná koncentráciou krotonyl-CoA, ktorá sa môže meniť na základe environmentálnych bunkových podmienok alebo genetických faktorov.[9]
Referencie
upraviť- ↑ A crotonyl-CoA reductase-carboxylase independent pathway for assembly of unusual alkylmalonyl-CoA polyketide synthase extender units. Nature Communications, 2016, s. 13609. DOI: 10.1038/ncomms13609. PMID 28000660.
- ↑ a b c DOBROTA, Dušan, a kol. Lekárska biochémia. 2. vyd. Martin : Osveta, 2016. 799 s. ISBN 978-80-8063-444-5. S. 290 – 291, 295 – 298.
- ↑ a b c d VOET, Donald. Biochemistry. 4th ed. Hoboken, NJ : John Wiley & Sons, 2011. ISBN 978-0-470-57095-1. S. 947 – 950, 1040 – 1042.
- ↑ Crotonyl-CoA [online]. . Dostupné online.
- ↑ The Synthesis of Butyric and Caproic Acids from Ethanol and Acetic Acid by Clostridium Kluyveri. Proceedings of the National Academy of Sciences, December 1945, s. 373–381. ISSN 0027-8424. DOI: 10.1073/pnas.31.12.373. PMID 16588706. (po anglicky)
- ↑ a b The energy metabolism of Clostridium kluyveri and the synthesis of fatty acids. The Journal of Biological Chemistry, February 1948, s. 659–669. ISSN 0021-9258. DOI: 10.1016/S0021-9258(19)52752-1. PMID 18901185.
- ↑ a b Studies on the substrate range of Clostridium kluyveri; the use of propanol and succinate. Archives of Microbiology, April 1985, s. 187–194. Dostupné online. ISSN 0302-8933. DOI: 10.1007/BF00408056. (po anglicky)
- ↑ Beyond ethylmalonyl-CoA: The functional role of crotonyl-CoAcarboxylase/reductase homologs in expanding polyketide diversity. Nat. Prod. Rep., 2012, s. 72–86. Dostupné online. ISSN 0265-0568. DOI: 10.1039/c1np00082a. PMID 22124767.
- ↑ Intracellular Crotonyl-CoA Stimulates Transcription through p300-Catalyzed Histone Crotonylation. Molecular Cell, 2015-04-16, s. 203–215. ISSN 1097-2765. DOI: 10.1016/j.molcel.2015.02.029. PMID 25818647. (English)
Pozri aj
upraviťZdroj
upraviťTento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Crotonyl-CoA na anglickej Wikipédii.